对这两种施肥方式的选择主要根据作物的种类、根系生长介质和施肥成本来确定。总体来讲按数量施肥的设备成本要低于按比例施肥。一般大田种植的作物多采用按数量施肥，而温室栽植的蔬菜花卉等多采用按比例施肥。因为温室栽培多采用砂、泥炭、岩棉等疏松透气的基质。这些基质虽然有很好的保水和通气性能，但对养分的吸附和缓冲性能低。给根系供应恒定的适宜的养分浓度，可使根系免受高浓度养分造成的肥害。在灌溉施肥中各种施肥设备有的是按数量施肥，有的是按比例施肥。 二、水肥一体化技术的优缺点。
同时，水肥一体化管理，水肥一体化技术可以防止耕地土壤质量退化。过量施用化肥往往造成土壤板结，同时由于过量养分不断在耕层富集，容易导致土壤盐渍化，造成土壤质量不断退化。而水肥一体化技术由于提高了肥料利用效率，可以降低化肥使用，水肥一体化喷灌，能有效避免土壤退化，有效改变土壤生态环境，有利于土壤健康。
灌溉施肥的程序分3个阶段：第一阶段，水肥一体化技术，选用不含肥的水湿润；第二阶段，龙岩水肥一体化，施用肥料溶液灌溉；第三阶段，用不含肥的水清洗灌溉系统。总之，水肥一体化技术是一项先进的节本增效的实用技术，在有条件的农区只要前期的投资解决，又有技术力量支持，推广应用起来将成为助农增收的一项有效措施。
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