此外，该技术有利于面源污染控制，发展清洁生产。由于水肥一体化技术应用可以实现肥料利用效率的提高，水肥一体化机器，因此可以减轻甚至避免农业施肥对土壤、水体面源污染的风险，同时，由于水肥的合理使用可以减少病虫害的发生，减少农药使用，提高农产品生产安全水平和农业生态水平，减轻农药残留对环境污染和对人体的危害。
节水省肥滴灌水肥一体化，水肥一体化，直接把作物所需要的肥料随水均匀的输送到植株的根部，作物“细酌慢饮”，大幅度地提高了肥料的利用率，可减少50%的肥料用量，水量也只有沟灌的30%-40%。减轻病害大棚内作物很多病害是土传病害，随流水传播。如辣椒疫病、番茄枯萎病等，采用滴灌可以直接有效的控制土传病害的发生。滴灌能降低棚内的湿度，减轻病害的发生。
与常规施肥方法相比，通过灌溉系统施肥有以下优点：（1）节省施肥劳力，宜都水肥一体化，特别对蔬菜和大棚内栽植的作物尤为明显。在果树的生产中，水肥管理耗费大量的人工。如华南的香蕉生产有些产地的年施肥次数达18次之多。每次施肥要挖穴或开浅沟，施肥后要灌水。利用设施灌溉施肥后水肥同步管理，节省大量劳力。作者在深圳西丽果场（主要种植荔枝）调查发现，采用滴灌施肥后，可节省施肥及灌溉的人工95％以上。现在劳动力价格越来越高，应用灌溉施肥技术可以显著节省生产成本。
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