最直接、最简单的节肥方法就是进行肥料深施。以尿素为例，深施后利用率可达47%-50%，而表施后利用率仅为25%。显然，深施可以明显提高肥料利用率，节省用肥成本。
肥料深施，一方面，可以减少因雨水、挥发等造成的养分流失，直接达到节肥目的；另一方面，深施后可增加根系对营养的吸收率，培育庞大粗壮的根系，可起到有效抗倒伏的作用，减少损失。例如肥料深施后，水肥一体化机器，水稻中下层根系数量可增加50%，增强了抗倒伏能力。
调查发现，倒伏是造成水稻减产的重要原因之一，包括根倒伏和茎倒伏两个方面。根倒伏主要是由于水稻根系入土较浅、下层根发育较差引起，而茎倒伏主要是由于茎基部较细，机械组织不发达引起。近年来，随着高产超高产水稻品种的推广，倒伏一直是该类品种发挥产量潜力的较大威胁。
根系是作物吸收养分的重要器官，旺健的根系源于良好的土壤营养环境，也是地上部旺盛生长的信息反馈。生产中培育庞大的根系能显著增加地上部生物量，增强抗倒伏能力，实现作物增产。肥料深施，能极显著增加水稻根系干重和体积，有助于提高根系固持力，增强水稻抗倒伏的能力。
但是，水稻深施用肥也存在一些难题，例如，当水稻插秧之后就无法进行深施肥料。这就要求在水稻插秧之前，一次性施下生长发育所需的所有养分，水肥一体化实施方案，而水稻控释肥可以解决这个难题。
2.2.3水肥耦合技术在高原特色农业中的应用根据土壤肥力和作物生态学原理，什么是水肥一体化，在土壤肥力测定的基础上，建立肥、水、作物产量为核心的耦合技术，合理施肥，培肥地力，以肥调水，以水保肥，充分发挥水肥协同效应和激励机制，提高抗旱能力和水分利用效率。增施有机肥料，可以增加土壤有机质含量，促进土壤团粒结构的形成，使土壤容重变小，孔隙度变大，能使雨水和地表径流水渗入土层中。有团粒结构的土壤能把渗入土壤中的水变成毛管水保存起来，以减少蒸发。因此，增施有机肥既能提高土壤肥力，又可改善土壤结构，增大土壤涵蓄水分的能力，增强根系吸收水分的能力，达到以肥调水、提高水分生产率的效果。通过调节施肥水平也可以获得较大的作物水分利用效率，莆田水肥一体化，通过以肥调水，提高农业用水利用效率。各地区可根据当地的实际情况，寻求以肥调水的方案，在实践中大力提高水资源利用效率。
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