随着现代科技的进步，日光温室蔬菜灌溉逐渐朝着高效节水方向发展，施肥技术也得到进一步提高。滴灌水肥一体化技术是在灌水的同时，将肥料一起滴入作物根部的土壤中。使作物能更好地吸收利用养分。日光温室蔬菜滴灌水肥一体化技术应注意以下事项：1、肥料应选用滴灌专用肥或速效性肥料，不能完全溶解的要先滤去未溶解颗粒，再倒入施肥罐。2、施肥时，待滴灌系统正常运行后，水肥一体化滴灌技术，再向施肥罐内注肥，以防止施肥速度过快或过慢造成施肥不均或施肥不足。滴灌系统运行一段时间，应打开过滤器下部的排污阀排污，施肥罐底部的残渣要经常清洗。3、每次运行，须在施肥完成后再停止灌溉。施肥是否完成可通过滴灌专用肥的颜色变化来确定，灌溉施肥过程中，若发现供水中断，应尽快关闭施肥罐上的阀门，水肥一体化，以防止肥液倒流。4、施肥后，应继续灌一段时间清水，以防化学物质积累堵塞孔口。每一灌溉季节过后，应将整个系统冲洗后妥善保管，以延长其使用寿命。
水肥一体化技术的局限性尽管技术成熟，有上述诸多优点，但该技术是一种设施灌溉和施肥，需要购买必须的设备。其最大局限性主要是一次性投资较大。根据近几年的灌溉设备和施肥设备市场价格估计，大田采用滴灌施肥一般每亩设备投资在600～1500元，而温室灌溉施肥的投资比大田高。投资大小与众多因素有关。产品质量是价格的主要确定因素。除投资外，水肥一体化技术对管理有一定要求，管理不善，容易导致滴头堵塞。如磷酸盐类化肥，在适宜的pH值条件下易在管内产生沉淀，使系统出现堵塞现象。用于灌溉的肥料对溶解度有较高要求。磷肥由于在土壤中移动性差，有人建议不通过灌溉系统施用磷肥（基质栽培除外）。采用滴灌时通常只湿润部分土壤，根系的生长可能只局限在灌水器的湿润区，有可能造成限根效应，造成植株矮小。这在干旱半干旱地区只依赖滴灌供水的地区可能会出现这种情况。但在华南地区有较丰富的降水，设施灌溉并不是水分的唯一来源，在此情况下基本不存在限根效应。
采用滴灌施肥方法可使作物在边际土壤条件下正常生长。如沙地或沙丘，因持水能力很差，水分几乎没有横向扩散，水肥一体化调研报告，传统的浇水容易深层渗漏，水肥管理是个大问题，通常作物很难正常生长。采用滴灌施肥技术后，可保证作物在这些条件下正常生长。国外已有利用先进的滴灌技术配套滴灌施肥开发沙漠，水肥一体化技术，进行商品化作物栽培的成功经验。以色列在南部沙漠地带广泛应用滴灌施肥技术生产甜椒、番茄、花卉等，成为冬季欧洲著名的“菜篮子”基地。如目前南方城市郊区采石场的复绿，要在悬崖峭壁上灌水施肥用传统办法非常困难，但采用滴灌施肥技术可解决这一问题。
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