由于滴头为精密部件，对灌溉水中的杂质粒度有一定的要求，滴灌要求粒度不大于120目，才能保证滴头不堵塞。如果水源过滤措施和设备符合要求，冷水江水肥一体化，井水、渠水、河水、山塘水等都可以用于滴灌。因此，水源过滤设备是滴灌系统的核心部件，大多数滴灌系统不能正常工作都是因过滤设备不符合要求或疏于清洗过滤器引起的。
滴灌的关键是防堵塞。选择合适的过滤器是滴灌成功的先决条件。常用的过滤器有砂石分离器、介质过滤器、网式过滤器和叠片过滤器。前两者做初级过滤用，后两者做二级过滤用。过滤器有很多的规格，选择什么过滤器及其组合主要由水质决定。这是较专业的问题，由专业人士设计和选择。
中国农业大学资源与环境学院教授陈清认为，推广水肥一体化技术是一项系统工程，水肥一体化设备，需要政府、科研机构、企业、行业组织等多方合力。我国灌溉农业面临巨大压力，灌溉可用水量增加潜力很小，水资源已经过度开发，发展节水农业成为政府、社会的共识，适用于不同区域和作物的节水灌溉技术在最近几年得到大力推广。水溶肥生产企业需要突破瓶颈，加强与灌溉设备企业对接，加强协同联动，共同满足现代农业大户的产品与技术服务需求。
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