高标准建设的滴灌系统造价在1000元/亩左右，设计寿命为10年，折合每年成本为100元/亩。安装滴灌后，水肥一体化，一方面可以节省肥料开支，按省肥30%计算，每年可节约开支30—50元/亩；另一方面可以增加产量和品质，从而增加收入，以增收10%计算，每年可增收120—800元/亩，这还没有考虑到节工和保障丰产等隐性的价值。可见，果树安装滴灌是十分划算的，我们不能因为滴灌一次性的投资大，不考虑综合成本与效益而主观认为不经济。
由于微灌系统对压力的要求较低，能够比较大限度的节约能源。以面积100亩的柑橘园滴灌系统为例，每年用电量约1200度，以现行电价计算，费用为732元，每亩能源投入只需7.32元。滴灌是最节能的灌溉及施肥方式。
随着人口增长，特别是工业化、城镇化进程加速，我国耕地减少、水资源匮乏等资源约束日益趋紧，与此同时，大水漫灌、过量施肥现象还比较普遍，水肥利用率不高。据统计，我国每年农业灌溉用水总量在3600亿立方米左右，化肥施用总量达5700万吨。为了提高水资源和肥料资源利用率，近年来，各级农业部门示范推广了水肥一体化技术，通过灌溉与施肥有机结合，实现了水肥同步管理和高效利用。
此外，该技术有利于面源污染控制，发展清洁生产。由于水肥一体化技术应用可以实现肥料利用效率的提高，因此可以减轻甚至避免农业施肥对土壤、水体面源污染的风险，同时，由于水肥的合理使用可以减少病虫害的发生，福建水肥一体化，减少农药使用，提高农产品生产安全水平和农业生态水平，减轻农药残留对环境污染和对人体的危害。
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