此外，该技术有利于面源污染控制，发展清洁生产。由于水肥一体化技术应用可以实现肥料利用效率的提高，因此可以减轻甚至避免农业施肥对土壤、水体面源污染的风险，同时，由于水肥的合理使用可以减少病虫害的发生，减少农药使用，水肥一体化标准，提高农产品生产安全水平和农业生态水平，减轻农药残留对环境污染和对人体的危害。
从对肥料浓度的控制条件看，通过灌溉系统施肥可以按下面两种方式进行。1、按数量施肥 施肥时只考虑每次施入的肥料总量。如对大田作物要求每亩施多少公斤肥料，对木本果树来讲每株施多少公斤肥料。在施肥过程中，随时间延长，水肥一体化技术，被灌溉水带走的肥料浓度越来越小，最后趋于零，漳州水肥一体化，这种施肥方法称为按数量施肥。传统的肥料撒施即是按数量施肥。绝大部分田间作物都是按数量施肥。2、按比例施肥（固定浓度施肥） 既考虑施肥数量同时又考虑施肥浓度，要求施肥时养分浓度是均匀一致的。这种施肥方法称为按比例施肥。
采用滴灌施肥方法可使作物在边际土壤条件下正常生长。如沙地或沙丘，因持水能力很差，水分几乎没有横向扩散，传统的浇水容易深层渗漏，水肥管理是个大问题，通常作物很难正常生长。采用滴灌施肥技术后，可保证作物在这些条件下正常生长。国外已有利用先进的滴灌技术配套滴灌施肥开发沙漠，滴灌水肥一体化技术，进行商品化作物栽培的成功经验。以色列在南部沙漠地带广泛应用滴灌施肥技术生产甜椒、番茄、花卉等，成为冬季欧洲著名的“菜篮子”基地。如目前南方城市郊区采石场的复绿，要在悬崖峭壁上灌水施肥用传统办法非常困难，但采用滴灌施肥技术可解决这一问题。
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